●動物:ヒト、ラット、マウス、チンパンジー、ニホンザル、クジラ、イヌ、コウモリ、スンクス、ワラビー、アフリカツメガエル、メダカ、シーラカンス、線虫、ショウジョウバエ、アゲハ、カイコ、クワコ、クマムシなど
●植物:イネ、シロイヌナズナ、アサガオ、ナンヨウアブラギリ、トマト、ヒメツリガネゴケ、サンゴ共生褐虫藻、緑藻類、紅藻類、微細藻類など
●微生物:ヒト常在菌、病原菌、光合成菌、極限領域生息細菌類、シロアリ共生細菌類、難培養細菌など
●メタゲノム:ヒト(腸内、皮膚、口腔)、海洋、河川、湖沼、土壌、温泉、活性汚泥、工業廃水など